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2008-09-01 の対応を取っても転送が60GBを越えた辺りで回線断されるようです。
まずはLANチップの上にファンを取り付け、/var/log/syslog に残されたエラーメッセージで検索してみました。
Sep 3 08:34:59 heppoko kernel: NETDEV WATCHDOG: eth0: transmit timed out
結果としては、TSO（TCPセグメンテーションオフローディング）という機能が邪魔をしているそうです。
# apt-get install ethtool # /usr/sbin/ethtool -K eth0 tso off
これで様子を見てみるとエラーが無くなっていますので、 /etc/rc.local に ethtool の実行処理を加えました。